يمكنك الانطلاق للغوص في مياه مرسى علم إما من الشاطئ مباشرة، أو على متن اليخوت المريحة والتي تخرج في رحلة غوص لمدة يوم أو نصف يوم. تقدم مرسى علم مجموعة فريدة من مواقع الغوص في ساحل البحر الأحمر، بدءا من الحشائش البحرية حيث يتغذى الأطوم أو بقرة البحر (الدوجونج) المراوغ، وحتى نقطة إنزال الغواصين حيد إلفنستون المرجاني شديدة الانحدار ومأوى سمك القرش ذو الطرف الأبيض المحيطي الخرافي.
هذه بعض من أشهر مواقع الغوص في مرسى علم:
أبو دباب: وهو بيت الأطوم أو بقرة البحر (الدوجونج)؛ ولا تكتمل إجازتك في مرسى علم بدون زيارة خليج أبو دباب ومحاولات العثور على الدوجونج المراوغ، فهذا المخلوق الجميل ذو الوجه الضاحك وسلوكه الودود خجول جدا في الحقيقة ويسهل إخافته.
صمداي: وهو يعرف أيضا ببيت الدلافين؛ يقع هذ الحيد المرجاني الهلالي حوالي 5 كيلومتر جنوب شرق مرسى علم. يتوجه الحيد ناحيتي الشرق والغرب صانعا بحيرة شاطئية طبيعية في الجنوب، بينما توفر مياه اللاجون المحمية هذه موطنا مناسبا للدولفين الدوّار (أو ما يعرف علميا بستينيللا لونجيروستريس).
حيد إلفنستون: موقع غوص للمحترفين فقط وذلك بسبب وجود التيارات البحرية القوية، وهو يمثل الحلم الأجمل لتجربة الغوص في البحر الأحمر. هناك الأسماك التي تعيش قرب السطح وسمك العقام (باراكودا) وأسوار الشعاب المرجانية الغنية بالحياة. وعلى الرغم من صعوبة الوصول إليه لوجوده في عرض البحر، إلا أن الوصول إلى حيد إلفنستون تجربة مثيرة في حد ذاتها.